Harnsteine können aus sehr unterschiedliche Verbindungen bestehen. Drei Typen überwiegen: Calciumoxalat-, Phosphat- und Harnsäure-Steine. Es gibt aber auch sehr unterschiedliche "Exoten". Auch Medikamente können in einigen Fällen steinbildend auftreten.

• Calciumoxalate (Whewellit und Weddellit, etwa 70-75%)
• Calciumphosphat
  (meist Carbonatapatit, etwa 10-15%)
• Magnesiumammoniumphosphat
  (Struvit, etwa 5-10%)
• freie Harnsäure (etwa 10-15%)
• Natrium- und Ammoniumurat
  (Salze der Harnsäure, etwa 1%)
• Calciumhydrogenphosphat
  (Brushit, etwa 1%)
• Cystin (etwa 1%)
• 2,8-Dihydroxyadenin (selten)
• Calciumcarbonat (sehr selten)
• Cholesterin (sehr selten)
• Xanthin (sehr selten)
• Medikamentensteine (sehr selten)